由于缺乏長期完整的揚州清曲表演計劃。自1999年以來，作為揚州清曲的故鄉(xiāng)——揚州市廣陵區(qū)文化主管部門建立了專門的研究室，開始從事較系統的研究及規(guī)劃工作。揚州市揚州清曲研究室、揚州曲藝之友社開始計劃全面搜集揚州清曲的曲目、演出照片、錄音、錄像。政府計劃支持揚州清曲研究室和揚州曲藝之友社加強揚州清曲藝術的復興工作，適時舉辦相關的藝術活動。

在2001年3月召開的“揚州清曲研究室2001年工作年會”上，來自揚滬等地的曲藝工作者及專家，集中探討了揚州清曲的藝術價值及生存狀態(tài)等問題，并與已被首批列入人類口頭與精神文化遺產的昆曲作了比較，發(fā)現兩者價值相近，但瀕危情況揚州清曲更甚：接著又詳細對照世界文化遺產評審規(guī)定，經過審慎研究，廣陵區(qū)文化局與揚州清曲研究室決定，將具有500多年歷史的揚州清曲申報世界文化遺產。

揚州清曲在2006年5月20日，經國務院批準列入第一批國家級非物質文化遺產名錄。