由于寺院在藏族社會中所占的特殊地位，使得它在建筑上具備許多特點。

1、寺廟要進行很多宗教活動，而修習經論仍是一項主要活動。一座寺廟，類似一所佛教大學。哲蚌寺內有教學、教儀、教務、雜務四大部分，下設三所顯宗學院，一所密宗學院。這些經學院，藏語稱扎倉，隸屬于寺廟最高管理機構“機康”。扎倉建筑由經堂、佛殿和前院組成，并附設供應喇嘛飲食茶水的大灶房和辯論經典的辯經場。扎倉下面，設若干個康村，康村是寺廟的基層學經僧團，其建筑稱扎夏，由僧舍、廚房、小經堂、內院辨經場、各種庫房組成。建筑一般為回字形內院式，層高以三至四層居多，有的高達五至六層。寺廟一級的大殿，稱措欽，即大集會殿的意思，其形制與扎倉相同，機康均設在二層。哲蚌寺措欽大殿的經堂面積達2000余平方米，可容納萬余僧人誦經。

2、寺院除了修習經論之外，還要進行語言、文字、詩歌、醫(yī)藥、天文、歷算教育，寺廟壟斷了藏族社會的文化事業(yè)。甘肅拉卜楞寺的“丁科扎倉”，是專修天文的，“曼巴扎倉”，是修習醫(yī)藥的。西藏山南敏珠林寺，也是以修醫(yī)藥為主的。這些建筑與一般扎倉大同小異，其它如印刷、出版、佛像佛器制造亦控制在寺廟手中，許多寺廟擁有專門作坊，如四川德格寺廟里設有很大的印經院。布達拉宮山下城堡里建有兩座印經院和一座佛像佛器制造作坊。日喀則的納唐寺，為藏族地區(qū)三大印經院之一，里面珍藏有納唐版大藏經一套和豐富的藏文印版。薩迦寺藏有印版二千余塊，大經堂內擁有佛教經典、歷史、醫(yī)藥、哲學、戲劇、詩歌、歷算、名人傳記等史籍上萬部。有些寺廟，如拉卜楞寺還設有類似圖書館的藏經樓。